9 марта 1861 года во всех храмах Пскова был прочитан Манифест об отмене крепостного права. В уездах чтение
Манифеста началось спустя несколько дней. В народе царили радость и ликование. Архиепископ Евгений читал
Манифест в Троицком соборе Пскова. После чтения Манифеста по просьбам прихожан повсеместно служились молебны о здравии государя Александра II Николаевича. Член Святейшего Синода архиепископ Псковский и
Порховский Евгений скончался 6 июля 1862 года в Пскове. Похоронили его в подцерковье Троицкого собора. Повелением императора Александра II от 12 октября 1870 года в Псковской духовной семинарии в память архиепископа Евгения (Баженова) учреждена стипендия его имени. Указом Святейшего Синода от 27 сентября 1862 года из Тобольска в Псков архиепископом Псковским и Порховским переведен Феогност (Лебедев). Как и его предшественники, свое служение Церкви Феогност начинал в монастыре. В 1848 году возведен в сан епископа Острогожского викария Воронежской епархии. Из Воронежской епархии Феогност в 1852 году переведен епископом Вологодским, в 1856 году назначен епископом Тобольским, возведен в сан архиепископа. 2 апреля 1865 года император Александр II утвердил устав Общины сельских сестер милосердия под названием «Мария Магдалина» в селе Буриги Порховского уезда. Начало общины относится к 1861 году. Дочь действительного тайного советника княжна Мария Михайловна Дондукова-Корсакова, сочувствуя бедственному положению, в котором нередко находилось сельское население, решила устроить в селе Буриги, принадлежавшем её брату, генерал-
лейтенанту князю Александру Михайловичу Дондукову-Корсакову, общину «для оказания нравственного и
материального пособия крестьянам, преимущественно в лечении больных и воспитании детей». Идею княжны поддержала императрица Мария Александровна. Она пожертвовала на строительство дома для общины 3000 рублей
серебром. Узнав о таком начинании, Санкт-Петербургский почетный гражданин С.В. Буторин также пожертвовал общине 3000 рублей серебром. Семейство князя Дондукова- Корсакова пожертвовало общине 4 десятины 244 сажени
земли, действительный тайный советник князь Михаил  Александрович Дондуков-Корсаков принял на себя затраты
по устройству общины. Мария Михайловна пожертвовала на нужды учреждаемой общины 40 тыс. рублей серебром.
М.М. Дондукова-Корсакова составила проект устава общины, который был одобрен Марией Александровной,
утвержден императором. Императрица приняла новую общину под свое покровительство.
В общине действовали отделение сестёр милосердия, амбулатория, аптека, школа и отделение для пансионерок.
Для больных, требовавших особого ухода, устроена больница на 8 кроватей. Княжеская домовая церковь стала
церковью и для общины. В комитет по управлению общиной вошел местный священник. Главными обязанностями
сестер были: уход за больными, утешение скорбящих, обучение крестьян грамоте, а летом, во время полевых работ,
наблюдение за крестьянскими детьми. Обучение детей в школе было бесплатным, по воскресным и праздничным
дням обучались также малолетние дети и взрослые крестьяне. Община существовала до рокового 1917 года.
В ноябре 1866 года по воле императрицы Марии Александровны, супруги Александра II, и по распоряжению
митрополита Московского Филарета в Псковскую губернию была командирована начальница Санкт-Петербургской
Покровской общины сестер милосердия игуменья серпуховского Покровского (Владычного) монастыря
Московской епархии Митрофания. Она ознакомилась с деятельностью общины сельских сестер милосердия Марии
Магдалины в селе Буриги Порховского уезда и предложила учредить в Пскове общину сестер милосердия, которая в
последующем могла стать главенствующей над общиной в Буригах и теми, которые возникли бы в других местах губернии. Архиепископ Псковский и Порховский Феогност высказался за учреждение общины в ведении епархиального
начальства. Готовность принять на себя начальство над учреждаемой общиной выразила настоятельница Псковского
Иоанно-Предтеченского монастыря Агния. 16 апреля 1868 года последовало определение Святейшего Синода,
разрешавшее передать учреждаемой общине церковь Святого пророка Божия Ильи (Ильинскую) и приступить к организации общины. Начала свою деятельность Псковская епархиальная Иоанно-Ильинская община сестер милосердия 14 ноября 1868 года. Название она получила от церкви, при которой учреждалась, и по названию монастыря, в ведение которого поступала. В Ильинской церкви общины при большом стечении народа, в присутствии товарища (заместителя) обер-прокурора Святейшего Синода Юрия Васильевича Толстого псковским архиереем Феогностом была совершена литургия и благодарственный молебен с возглашением многолетия императору Александру II, покровительнице общины императрице Марии Александровне, и всем благотворителям. Ильинская церковь, бывшая до этого приписной к церкви Святых Космы и Дамиана, стала самостоятельной. С первых дней существования община ставила своей задачей помощь в духе христианского милосердия, труда, самоотвержения и нравственности всем бедным жителям г. Пскова и ближайших местностей, оказывать им медицинскую помощь, бесплатно отпускать лекарства, воспитывать и давать образование бесприютным младенцам и детям обоего пола без различия сословий.Община брала на себя подготовку сестер милосердия на уровне фельдшерских знаний, «дабы они в мирное время могли с пользой употребляться для дежурства в общественных больницах, а в военное время служили бы раненым больным воинам на поле брани и доставляли бы им нужные медицинские пособия». На воспитание было принято 35 беспризорных детей, устроена школа для детей бедняков, открыто училище для девушек, желавших стать сестрами милосердия, приёмный покой с аптекой для бедных больных, которым помощь оказывалась в любое время, бесплатно отпускались лекарства, устроен дом для причта, операционное отделение, амбулатория, отделение для воспитания грудных детей. В 1868 году община явилась новым и единственным учреждением в России и находилась под постоянным вниманием и попечением императрицы Марии Александровны. По ее предложению игуменья Митрофания была оставлена в общине, чтобы помочь игуменье Иоанно-Предтеченского монастыря Агнии наладить новое дело и передать ей свой опыт. Большую помощь общине при ее становлении оказали псковские врачи, которые стали постоянными врачами общины. Они безвозмездно лечили больных, обучали сестер милосердия. Обучением девочек в школе занимались духовенство, монахини, сестры милосердия. Одна из девочек-сироток содержалась в общине  на средства императрицы, которая ежегодно вносила 120 рублей на ее содержание. В 1874 году, в ознаменование бракосочетания великой княжны Марии Александровны, дочери императора Александра II и покровительницы общины императрицы Марии Александровны, церковные причты постановили ежегодно отчислять из церковных сумм на содержание общины 2500 рублей. После смерти в 1880 году императрицы Марии Александровны община перешла под покровительство её невестки, цесаревны (с 1881 года императрицы) Марии Федоровны. Деятельность общины продолжалась до событий 1917 года. 3 апреля 1867 года императору Александру II от жителей города Торопца в память избавления его от руки убийцы преподнесен список с чудотворной иконы Корсун-
ской Божией Матери. По преданию, икона была оставлена Торопцу Полоцкой княжной, супругой князя Александра
Невского Параскевой.  27 декабря 1867 года император Александр II утвердил мнение Государственного Совета, в соответствии с которым с 1 января 1868 года отменялось существовавшее с XVIII века разделение епархий на классы, утверждены новые штаты епархий. 13 июля 1868 года священнику Голубеву разрешено при губернской типографии открыть славянскую типографию. В типографии печатались религиозно-нравственные издания.
Архиепископ Феогност скончался 22 апреля 1869 года. Он похоронен по обряду, подобающему его сану, в
подцерковье Троицкого собора. Из Вологды 7 июля 1869 года епископом Псковским и Порховским переведен Павел (Прокопий Доброхотов).
Он родился в 1807 году, свое служение начал ректором Вятской духовной семинарии, в 1866 году возведен в сан
епископа Вологодского. Одним из первых деяний епископа Павла в Пскове стало утверждение 14 декабря 1869 года устава братства  во имя Святого благоверного князя Александра Невского при домовой церкви Псковской гимназии. Целью братства было попечение о бедных учениках губернской гимназии, енских училищ в Псковском, Опочецком, Порховскомуездах, в уездных училищах губернии, а также о гимназическом раме Святого Александра Невского.
1874 год ознаменовался открытием в Великих Луках городского приходского женского училища. 8 мая 1876 года
в Пскове открыт музей Археологической комиссии, созданный стараниями видных псковских историков и краеведов.
Среди членов комиссии был протоиерей Троицкого собора Михаил Иоаннович Кунинский (1796-1874 гг.). Он
преподавал в Псковской духовной семинарии, был смотрителем Псковского уездного духовного училища, известен
как любитель и собиратель псковских древностей. Ему посчастливилось отыскать такой памятник письменности
XVII века как «Книга псковитина посадского торгового человека Сергея Иванова сына Поганкина».
В 1877 году началась Русско-турецкая война за освобождение славян Балканского полуострова от пятисотлетнего
турецкого ига. В составе псковского подвижного санитарного отряда, отправленного в 1877 году на юг для
ухода за ранеными, находилось 11 сестер Иоанно-Ильинской общины.В 1878 году Псков посетили великие князья, сыновья императора Александра II, Сергей и Павел Александровичи, и их двоюродные братья великие князья Константин и Дмитрий Константиновичи. В традициях воспитания членов императорской фамилии было наглядное ознакомление с историей, культурой России, жизнью и бытом населения.
В Пскове они находились с 8 по 12 июля. Великие князья посетили Изборск, Печерский монастырь, Выбуты.
26 октября 1880 года начало свою работу Псковское археологическое общество (ПАО). В числе членов-основателей
общества были епископ Псковский и Порховский Павел, инспектор Псковской духовной семинарии С.В. Ко-
хомский. Епископ Павел на первом же заседании пожертвовал обществу 600 рублей, с которых начался запасной
капитал общества.
8 сентября 1881 года Псков торжественно отметил 300-летие избавления Пскова от польских войск Стефана
Батория. После литургии в Троицком соборе состоялся крестный ход под колокольный звон всех церквей. В этот
день состоялась закладка памятника защитникам города. Памятник дошел до наших дней. Современный вид памятник приобрел в 1897 году.
23 января 1882 года епископ Павел переведен архиереем Олонецкой епархии. Скончался он 23 апреля 1900
года.
6 марта 1882 года епископом Псковским и Порховским назначен Нафанаил (Николай Иванович Соборов).
Он родился в семье священника, учителя духовного училища Рязанской епархии. Окончил Киевскую духовную академию с званием магистра богословия, преподавал в Воронежской духовной семинарии. 15 марта 1852 года молодой преподаватель принял монашество с именем Нафанаил. В 1860 году его перевели инспектором духовной семинарии в Орёл. В 1866 году архимандрит Нафанаил назначен ректором Тверской духовной семинарии и одновременно настоятелем Тверского Отроча монастыря. В 1872 году он возведён в сан епископа Новомиргородского викария Херсонского. После Херсона епископ Нафанаил в 1879 году
назначен в Архангельскую епархию. В Псков епископ Нафанаил прибыл 5 июня 1882 года.
При владыке Нафанаиле 20 ноября 1883 года начал свою деятельность свечной завод в Псково-Печерском
монастыре. Завод был открыт по предложению владыки на деньги монастыря. По некоторым сведениям деньги
на устройство завода были выделены также настоятелем Никандровой пустыни архимандритом Серафимом. Прибыль от продажи свечей шла на нужды епархии, главным образом на устройство и содержание епархиального женского училища. Производством и отпуском свечей занимались иеромонахи Псково-Печерского монастыря. Для
снабжения свечами церквей в уездах с самого основания завода были устроены склады при церквах в городах и в
некоторых сёлах. В конце 1884 года было решено перевести завод в Псков и передать его в ведение епархии. С 1891
года только на средства свечного завода содержался класс Псковской духовной семинарии, выделялись пособия семинарии на хозяйственные нужды. В 1883 году в Великих Луках в память Царя-освободителя
Александра II на добровольные пожертвования построена часовня. В 1884 году в Псковской епархии под
началом правящего архиерея начал деятельность епархиальный училищный совет, непосредственно управлявший
церковно-приходскими школами и школами грамоты. Епископ Нафанаил управлял Псковской епархией недолго:
19 февраля 1885 года его вновь перевели в Архангельскую епархию. 3 июня 1890 года он был уволен на покой.
Скончался епископ Нафанаил в Москве 29 апреля 1907 года. Он был погребен в особой часовне под колокольней
Спасо-Андроникова монастыря. Могила его не сохранилась. Где бы ни приходилось служить Нафанаилу, он жертвовал
крупные суммы на стипендии в академиях, семинариях, духовных училищах, благотворительным учреждениям.
Епископом Псковским и Порховским 9 марта 1885  года назначен Гермоген (Константин Петрович Добронравии).
Он родился в Санкт-Петербургской губернии 21 февраля 1819 года в семье священника. Духовное образование
Константин получил в Петербурге в Александро-Невском духовном училище, затем в Санкт-Петербургской
духовной семинарии и Санкт-Петербургской духовной академии. По окончании академии был наставником в
Московской духовной академии. В сане священника служил на Волковом кладбище в Петербурге. 1 сентября 1873
года Константин Добронравии пострижен в монашество с именем Гермоген. В 1873 году возведен в сан епископа Выборгского (Ладожского), викария Петербургской епархии. В 1882 году Гермоген назначен епископом Таврическим и
Симферопольским. В Псков владыка прибыл 30 апреля 1885 года. В том же году, 17 декабря, им утвержден устав Кирилло-Мефодиевского братства при Псковском кафедральном Троицком соборе. В задачу братства входило оказание материальной поддержки епархиальному женскому училищу открытому 14 октября 1884 года, и церковно-приходским школам епархии. Псковский епископ являлся попечителем братства. За первый год членами братства собраны значительные денежные суммы, большую часть их зачислили в основной
капитал, меньшую часть передали учебным заведениям. Основной капитал братства был обращен в процентные бумаги, доход от них также шел на поддержку епархиальных училищ и школ. Кроме членских взносов и сбора пожертвований, практиковались чтения лекций, весь сбор от них шел в пользу братства.
14 декабря 1891 года произошло одно, казалось бы, рядовое событие в жизни епархии. В домовой церкви Псковской
духовной семинарии во имя Трех Святителей епископ Гермоген совершил постриг в монашество преподавателя
семинарии Василия Ивановича Беллавина. На следующий день, 15 декабря, за литургией в Троицком соборе инок Тихон был рукоположен в первый сан - иеродьякона. Пройдут годы, вся Россия, весь мир узнают его с другим титулом:
Патриарх Московский и всея Руси. 4 июня 1892 года император Александр III утвердил мнение Государственного Совета об отпуске из казны с 1 января 1893 года 600 рублей на содержание православного эстонского причта при церкви в Ведриловской пустоши  Псковской епархии. В окрестности пустоши жило много эстонцев, и большая часть из них желали принять православное исповедание, однако православных церквей в округе не было. Первой была построена Покровская церковь в Ведрилово. Со временем здесь возникла женская община, впоследствии ставшая Покровским женским монастырем. Во время пребывания в 1893 году в Санкт-Петербурге
епископ Гермоген заболел воспалением лёгких и после кратковременной болезни в полном сознании 17 августа
1893 года скончался. Согласно его воле, он похоронен в Исидоровской церкви Александро-Невской лавры. 

Чин погребения совершил митрополит Палладий со всеми находившимися в столице епископами и многочисленным
петербургским и псковским духовенством. На панихиде по епископу Гермогену присутствовал министр народного
просвещения И.Д. Делянов.